تعاقدت الإدارة العامة للتدريب مع العديد من الأكاديميات والجامعات الحكومية والخاصة للمساعدة في تطوير العاملين ورفع مهاراتهم الفنية والتكنولوجية، ومن أهم البروتوكولات العلمية التي تم عقدها:

• بروتوكول تعاون مع الأكاديمية العربية للعلوم والتكنولوجيا والنقل البحري
• بروتوكول تعاون مع أكاديمية يوسي ماس العالمية (يوسي ماس مصر)
• برتوكول تعاون جامعة الإسكندرية لدراسة الماجستير المهني لإدارة الأعمال
• بروتوكول تعاون مع الشركة العربية لنظم المعلومات الصحية (هستكس)
• بروتوكول الشركة المصرية للتعليم التنافسي (مايندز)
• برتوكول تعاون مع نقابة المهندسين
• برتوكول تعاون مع جمعية تكنولوجيا العلوم
• برتوكول تعاون مع نقابة الاجتماعيين بمطروح
• برتوكول تعاون مع نقابه المحامين
• بروتوكول تعاون مع جمعية سيوة للتنمية المحلية وحماية البيئة